Serdar Özbayraktar Sporcu kariyerine Hopaspor’da top oynayarak başladı. Futbol hayatını Gençlerbirliği, Hacettepe, Şanlıurfaspor, Mardinspor ve Gaziantep Büyük Şehir Belediyespor takımlarında top oynayarak sürdürdü. Daha sonrasında Eskişehirspor’a transfer oldu. 5 Yıl bu takımda oynayan Özbayraktar 2012 yılında sözleşmesinin bitmesiyle ayrıldı.

Kariyerine Artvin Hopaspor'da başlayan oyuncu, daha sonra sırasıyla Gençlerbirliği, Hacettepe SK, Şanlıurfaspor, Mardinspor ve Gaziantep Büyükşehir Belediyespor takımlarında oynamış, 2007-08 sezon başında Eskişehirspor'a transfer olmuştur. Sözleşmesi 31 Mayıs 2012'de sona erdi.

2012-13 sezonu öncesi Gaziantepspor ile anlaştı.[3] 2014-15 sezonuna 1. Lig ekiplerinden Şanlıurfaspor'da başladı, devre arasında aynı ligde mücadele eden Elazığspor'a transfer oldu.